Ninjago City est sous la protection de six adolescents masqués, experts en arts martiaux, entraînés par le vénérable maître Wu et menés par l'intrépide neveu de ce dernier, le ninja vert. Or, dans le civil, ce garçon sensible appelé Lloyd est le fils de Garmadon, un seigneur de guerre qui n'a de cesse de conquérir leur ville. Pour mettre fin aux assauts de son père mégalomane, le ninja vert utilise contre lui «l'arme ultime». Mais ce faisant, il provoque la quasi-destruction de Ninjago City. Capturé par les justiciers, Garmadon leur propose de les accompagner dans leur quête de «l'ultime arme ultime», la seule capable de rétablir l'ordre et la paix dans la ville.