Échappé par son père alors qu'il était encore dans son oeuf, le jeune manchot empereur Mumble est né différent des autres. Il n'arrive pas à chanter comme ses congénères, mais il sait par contre s'exprimer par la danse grâce à ses pieds agiles. Ce talent inhabituel, auquel se greffe une nature rebelle, font de lui un être marginal, vu d'un mauvais oeil par les anciens de la tribu à qui ses idées farfelues ne plaisent guère. En effet, Mumble croit pouvoir expliquer la disparition des bancs de poissons par l'intervention d'extraterrestres qui auraient envahi leurs territoires de chasse. Expulsé de la tribu pour hérésie, Mumble part à la recherche de ces êtres d'un autre monde, en compagnie de quelques petits pingouins enjoués rencontrés par hasard.